Nastolatek, spoglądając przez teleskop, odkrywa, że planeta Icarus zmierza na kurs kolizyjny z Ziemią. Wyśmiany przez środowisko naukowe, zostaje porwany i przywieziony do tajnej bazy ONZ w japońskich Alpach. Natychmiast zostaje wcielony do tajnego programu, którego celem jest ukończenie działa Super-Destruction Beam i zniszczenie Icarusa. Do soczewki działa brakuje specjalnego minerału. Zespół wyrusza na tajemniczą wyspę pośrodku Pacyfiku. Odkrywa tam starożytne ruiny Atlantydy, lecz nagle zostaje zaatakowany przez dziwny metalowy statek kosmiczny w kształcie wiertła i kałamarnicy. Dowodzi nim zła istota Nazu, która doprowadziła do kolizji z Icarusem! Nie chce dzielić wszechświata z ludźmi i za nic nie chce dopuścić do ukończenia działa. Rozpoczyna się akcja, a zespół odkrywa Golden Bat, który spał przez ponad 10 000 lat, czekając na tę właśnie chwilę, by ocalić Ziemię!