Anthon jest cenionym fizykiem badającym ciemną materię — cząstki, o których nic nie wiemy, a które stanowią 95% naszego wszechświata. Życie Anthona wywraca się do góry nogami, gdy jego jedenastoletni syn Thomas zostaje porwany przez Elenę, tajemniczą kobietę. Od tej chwili Anthon musi szukać nie tylko syna, lecz także samego siebie. Dark Matter to refleksja nad mrocznymi tajemnicami naszego wszechświata i nad tym, jak odnosimy się do nieznanego.