Po masakrze w Ukishimie Saya traci pamięć i błąka się po slumsach, aż spotyka Haru, nielicencjonowaną lekarkę, oraz Ran, dziewczynę polującą na Elder Bairns. Gdy odzyskuje pamięć, odkrywa, że w przeszłości łączyły ją relacje z obiema, a także że klan Nanahara i jej nemezis, Fumito, złożyli sekretne obietnice. Kiedy Sayo próbuje uratować porwaną Haru, ponownie spotyka Fumito. Ten film fabularny opowiada nieznaną historię rozgrywającą się w okresie pomiędzy 12-odcinkowym anime telewizyjnym z 2011 roku, stworzonym przez Production I.G i Nanase Ohkawa (CLAMP), a jego filmową kontynuacją Blood-C: The Last Dark z 2012 roku.