Szesnaście lat temu tajemniczy zamaskowany ninja uwalnia na Wioskę Ukrytego Liścia Konoha potężne stworzenie znane jako Lis-Demon o Dziewięciu Ogonach, zabijając wiele osób. W odpowiedzi Czwarty Hokage Minato Namikaze i jego żona Kushina Uzumaki, żywe więzienie Demonicznego Lisa, czyli Jinchūriki, zdołali zapieczętować stworzenie w swoim nowo narodzonym synu Naruto Uzumakim. Po zapieczętowaniu Ogoniastej Bestii wszystko toczyło się normalnie. Jednak w teraźniejszości pokój dobiegł końca, gdy grupa ninja zwana Akatsuki zaatakowała Konohę pod przewodnictwem Tobiego, tajemniczego zamaskowanego mężczyzny stojącego za szaleństwem Lisa sprzed lat, który zamierza zrealizować swój plan zawładnięcia światem poprzez spowicie go iluzjami.