Morze wokół Minamaty zostało silnie zanieczyszczone rtęcią w latach 50. i 60. XX wieku przez fabrykę chemiczną należącą do Chisso Corporation. Ta wysoce toksyczna substancja ulegała bioakumulacji w skorupiakach i rybach w Morzu Yatsushiro, a jej spożywanie przez miejscową ludność doprowadziło do rozwoju choroby Minamata. Choroba ta była przyczyną śmierci i niepełnosprawności tysięcy mieszkańców całego obszaru wokół Morza Yatsushiro. Ekosystem morski również został w znacznym stopniu zniszczony.