Dwaj zmęczeni pracą mężczyźni odwiedzają miasto Chichibu, by oddać się swojemu ulubionemu hobby — eksplorowaniu jaskiń. Nie wiedzą jednak, że od okresu Sengoku miasto potajemnie chronią potomkowie prawych ninja z klanu Shinobi. Dwaj pechowi przyjaciele przypadkowo przełamują zaklęcie, które budzi dwie kolosalne bestie, Jaron i Goura. Rywalizujące klany z okolicy manipulują nimi, by doprowadzić do zaciekłej walki, siejącej chaos w całym regionie. Wtedy do akcji wkracza prawa kunoichi, która chce powstrzymać zniszczenia i odnowić pieczęć. Czy zdoła pokonać złych ninja, którzy stają jej na drodze, zanim Chichibu zostanie całkowicie zniszczone przez dwa kaiju?