Trójka krewnych osób zaginionych przemierza długą i złożoną drogę w poszukiwaniu szczątków swoich bliskich, mierząc się z procesami biurokratycznymi, prawnymi i społecznymi, które trwają od czasu wojny domowej. Atlas of disappearance odtwarza to, co próbowały ukryć zapomnienie i represje. Za pomocą map cyfrowych, archiwów i architektury sądowej film ukazuje milczące przeniesienie tysięcy zaginionych osób do Doliny Cuelgamuros w czasach dyktatury Franco. Pośród nieobecności i milczenia film przedstawia nieustanną walkę o odzyskanie prawdy, przywracając imiona i miejsce tym, których wymazano z historii.