Jim Phelps i jego zespół agentów otrzymują misję zniszczenia południowoazjatyckiej organizacji przemytników narkotyków znanej jako „The Golden Serpent” oraz odnalezienia dokumentacji jej transakcji handlowych. Tożsamość przywódcy organizacji zawsze pozostawała tajemnicą. Wiadomo jednak, że inny zespół agentów IMF, który niedawno zajął się jedną z ważnych postaci organizacji, księciem Selimunem z Benarli, właśnie poniósł porażkę, a jego przywódca został zamordowany.