Sho i jego przyjaciel Tetsurou natrafiają w lesie na dziwny artefakt pochodzenia pozaziemskiego. Wówczas artefakt uwalnia się z metalowych więzów i wnika w ciało Sho, przemieniając go w Guyvera. Dzięki nowej mocy Sho musi stawić czoła złowrogiej korporacji Chronos i jej genetycznie ulepszonym Zoanoidom, którzy chcą sprowadzić Guyvera z powrotem do swoich laboratoriów. Nikt z bliskich Sho nie jest bezpieczny przed Chronos. Musi walczyć.