BRAKHAGE zgłębia głębię i rozmach geniuszu filmowca, wyrafinowane piękno jego filmów, jego osobisty magiczny urok, jego artystycznych towarzyszy oraz wpływ, jaki jego twórczość wywarła na całe pokolenia innych twórców. Dotykając istotnych momentów w biografii Brakhage’a, film celebruje jego wizjonerski geniusz i bada niezwykłe artystyczne możliwości kina — medium znanego przede wszystkim z komercyjnych zastosowań w postaci narracji filmowych, kreskówek, filmów dokumentalnych i reklam. BRAKHAGE łączy fragmenty filmów Brakhage’a oraz filmów innych awangardowych twórców (m.in. George Kuchar, Jonas Mekas, Willie Varela, Bruce Elder i inni); wywiady z Brakhage’em, jego przyjaciółmi, rodziną, współpracownikami i krytykami; materiały archiwalne z udziałem Brakhage’a, obejmujące okres minionych trzydziestu pięciu lat; oraz zdjęcia realizowane w plenerze w Boulder w Kolorado i w Nowym Jorku.