Po chaotycznym napadzie Lupin i Jigen niespodziewanie zostają opiekunami małego chłopca, a młoda podniebna piratka imieniem Yutika rusza tropem ich łupu. Yutika pochodzi z miasta-państwa Shahalta, które niedawno dostało się pod rządy podejrzanego ministra. Wkrótce banda Lupina i Yutika łączą siły, by odkryć jeden z największych skarbów Shahalty, stając do walki zarówno z władzami Shahalty, jak i z Zenigatą.