A Boy Named Sue opowiada o sześcioletniej przemianie Theo, osoby transpłciowej, z kobiety w mężczyznę. Śledząc zachodzące w tym czasie zmiany fizjologiczne i psychologiczne Theo, a także ich wpływ na jego partnerkę lesbijkę i grono bliskich przyjaciół, A Boy Named Sue opowiada o tożsamości płciowej, relacjach i o tym, że zmienić może się nawet to, co wydaje się trwałe.