Na tle fikcyjnej II wojny światowej w międzynarodowym mieście w Azji. W Japonii podpułkownik Yuki (Yusuke Iseya) rekomenduje utworzenie szkoły szkolenia szpiegów „D Kikan”. Tymczasem Kato (Kazuya Kamenashi) staje w obliczu kary śmierci za odmowę wykonania rozkazu przełożonego. Następnie Kato zostaje zwerbowany przez „D Kikan”. Przechodzi ciężkie szkolenie i podejmuje swoją pierwszą misję jako szpieg. Aby przejąć poufne dokumenty amerykańskiego ambasadora Grahama, „Black Note”, Kato przenika do międzynarodowego miasta. Rozpoczyna się walka o przejęcie „Black Note” między Kato, tajemniczą kobietą imieniem Rin (Kyoko Fukada), brytyjską agencją szpiegowską, radziecką agencją szpiegowską a radykalną armią w Japonii.