Tajemnicze stworzenie niszczy część Księżyca, a następnie ostrzega, że jeśli nie zostanie zniszczone przed marcem następnego roku, Ziemia będzie następna. Domaga się również, by zostać wychowawcą klasy E, trzeciej klasy w liceum Kunugigaoka. W miarę zbliżania się terminu zamachu i daty końca świata uczniowie odkrywają swoje prawdziwe umiejętności oraz szokującą tożsamość Koro-senseia.