Gromadząc swoje siły na Morzu Śródziemnym, floty Earth Alliance i Orb Union przypuszczają drugi atak na Minervę, a tym razem nawet interwencja Archangela nie jest w stanie powstrzymać walk. Podczas gdy Shinn daje upust swojej złości przeciwko flocie Orb, Kira i Athrun stają naprzeciw siebie w walce, a jeden z tych przyjaciół od dzieciństwa ponosi porażkę. W ojczyźnie PLANT Chairman Durandal wspomina swoją przeszłość i rozważa plany na przyszłość... plany, które będą wymagały usunięcia destrukcyjnych elementów, takich jak Lacus i załoga Archangela. W następstwie bitwy Shinn podejmuje brzemienną w skutki decyzję. Stella, pilotka wroga, której niegdyś obiecał ochronę, jest teraz więźniem na pokładzie Minervy. Stan fizyczny Stelli szybko się pogarsza, a Shinn będzie musiał zdradzić wszystko, w co wierzy, aby ocalić jej życie.