Dążąca do zniszczenia ludzkości tajna podziemna organizacja Shocker potajemnie planowała pogrążyć świat w chaosie. Nie przewidziała jednak buntu obojga swoich eksperymentalnie „zrekonstruowanych” ludzi — Kamen Riders. Dwa lata po ich pierwszej walce z Shocker pojawia się trzeci Rider, by stawić im czoła, znany jedynie jako „Version 3”. Pojawienie się trzeciego Kamen Ridera wciągnie bohaterów w ich najstraszliwszą dotąd walkę, a los świata zawiśnie na włosku.