PRISON SISTERS ukazuje drogę dwóch młodych kobiet, które wyszły z więzienia w Afganistanie. Po wyjściu na wolność wytchnienie, jakiego zaznały w więzieniu, ustępuje miejsca groźbom śmierci i przemocy. Jako kobiety i byłe więźniarki Sara i Najibeh nie mają żadnego prawa do istnienia. Wujek Sary zamierza ją zabić, próbując odzyskać honor w swojej małej wiosce. W obawie o życie Sara ucieka do Szwecji i ubiega się o azyl, ale Najibeh zostaje. Gdy Sara próbuje zrozumieć odzyskaną wolność, jej współwięźniarka Najibeh znika, a wkrótce Sara dowiaduje się, że została ukamienowana. Sara i filmowiec chcą poznać prawdę, ale na ulicach Afganistanu trafiają jedynie na labirynt półprawd. Śledzimy losy dwóch głównych bohaterek i odkrywamy, co je spotkało — każda z nich ma wyjątkowy los, ukazujący przerażającą rzeczywistość kobiet w Afganistanie.