Wyznaczony do schwytania Mukade, zaginionego ninja, Naruto Uzumaki wyrusza do niegdyś wspaniałych, historycznych ruin „Ouran”, gdzie ściga i osacza zbiegłego ninja. Okazuje się, że celem Mukade jest uśpiona żyła energetyczna znajdująca się w ruinach; uwalnia on jej moc, a światło spowija Naruto i przenosi go w przeszłość, 20 lat przed wydarzeniami z początku serii. Kiedy Naruto odzyskuje przytomność, spotyka Czwartego Hokage, Minato Namikaze.