Minęły około dwa miesiące od porwania. Sousuke Sagara, członek organizacji antyterrorystycznej Mithril, nadal prowadzi tajne życie licealisty, pełniąc jednocześnie funkcję ochroniarza Kaname Chidori. Pewnego dnia nowa grupa terrorystyczna o nazwie A21 rozpoczyna działalność w ukryciu, biorąc na cel Tessę, młodą kapitan okrętu podwodnego Mithril. W miarę jak zagrożenie rośnie, Sousuke i jego sojusznicy zostają wciągnięci w kolejny niebezpieczny konflikt.