Trzech mężczyzn skazanych na śmierć zostaje ułaskawionych i przemienionych w „cienistych egzekutorów” — grupę bezwzględnych ninja pracujących dla tajemniczych wysoko postawionych urzędników. Podczas śledztwa w sprawie nielegalnej działalności jeden z nich, zwany „Żmiją Yazuke”, odnajduje swoją porzuconą córkę Ocho, która została kochanką przemytnika Denzo. Po śmierci Yazuke Ocho również zostaje zwerbowana jako „cienista egzekutorka”, z zadaniem dokończenia misji ojca.