Opowieść umiejscowiona jest w czasie wojny domowej w Japonii. Ieyasu Tokugawa zwycięża wojnę i w 1600 roku ustanawia shogunat. Mimo to, kraj roi się od zwolenników rodu Toyotomi, planujących zbrojny odwet. Aby zapobiec ponownej wojnie, ktoś musi cicho i definitywnie pozbyć się głównych pieniaczy. Gessai Obata otrzymuje rozkaz podjęcia się tego zadania i rozpoczyna trening dziesięciu osieroconych dzieci ? przyszłych zabójców. Dziesięć lat później młodzi wojownicy - Azumi, Nachi, Ukiha, Hyuga, Amagi, Nagara, Yura, Awa, Hiei, Komoro ? rozpoczynają misję, jednak tylko połowa z nich będzie mogła się jej ostatecznie podjąć...