Akcja rozgrywa się w epoce restauracji Meiji w małej wiosce na Kiusiu w Japonii. Historia koncentruje się na młodym chłopcu imieniem Izana i niewidomej kobiecie imieniem Takiri, którzy spotykają wielkiego potwora Nebula, od czasów starożytnych budzącego lęk jako bóg jeziora Amenosagiri. Tematem filmu jest japońskie pojęcie światła i ciemności, przedstawione za pomocą lalkarstwa i miniaturyzacji świata filmu, z wykorzystaniem praktycznych efektów specjalnych autorstwa Keizo Murase.