Amanda Morales weszła do kościoła w Nowym Jorku, nie wiedząc, kiedy znów wyjdzie na zewnątrz. Gwatemalska matka trojga dzieci urodzonych w USA jest pierwszą imigrantką od objęcia urzędu przez prezydenta Trumpa, która schroniła się w Nowym Jorku, publicznie sprzeciwiając się deportacji w miejscu uznawanym przez ICE za chronione. Sanctuary zapewnia rzadki, intymny wgląd w życie Amandy i jej rodziny, którzy walczą o to, by pozostać razem, i przystosowują się do codziennego życia w kościele.