Mana to android opracowany przez firmę Polarborn, zajmującą się tworzeniem postaci. Po ukończeniu prac planowana jest produkcja masowa, a projekt nosi nazwę „Mana Project”. Takuma, twórca projektu postaci, który uczestniczy w projekcie 3D w charakterze obserwatora, otrzymuje propozycję zamieszkania z prototypem. Tymczasem Jun, rywalka głównej bohaterki Many, jest również jedną z postaci stworzonych w ramach tego samego projektu...