W alternatywnej rzeczywistości świat został podzielony między trzy supermocarstwa, z których jednym jest Święte Imperium Brytanii. Japonia, po inwazji Brytanii, zostaje przemianowana na Strefę 11, a jej mieszkańcy tracą wolność i tożsamość narodową. Lelouch Lamperouge, młody książę wygnany przez własne imperium, otrzymuje nadnaturalną moc Geass - zdolność wydawania absolutnych rozkazów. Ukrywając się pod maską Zero, Lelouch staje na czele japońskiego ruchu oporu, marząc o świecie, w którym jego niewidoma siostra Nunnally będzie mogła żyć w pokoju. Jednak droga do wolności prowadzi przez zdrady, ofiary i moralne dylematy, które zacierają granicę między bohaterem a tyranem.