Nowa obsada bohaterów podejmuje nieustającą walkę dobra ze złem. Gingka, nasz bohater, wraz z grupą lojalnych przyjaciół stawia czoła niebezpiecznej organizacji zwanej Dark Nebula. Misją Dark Nebula jest przejęcie władzy nad światem i rozpętanie w nim zła, lecz zanim będą mogli tego dokonać, muszą zniszczyć Gingkę, ponieważ tylko on jest na tyle silny, by stanąć im na drodze. Fabuła się komplikuje, gdy przyjaciele stają się wrogami, a wrogowie — sojusznikami. Wszystko zaczyna się i kończy na Gingce, który zmaga się z odnalezieniem siły, by bronić swojego świata i honoru Beyblade.