Akcja serialu „Przejście” toczy się w tajnym ośrodku medycznym, znanym jako Projekt Noe, gdzie naukowcy prowadzą eksperymenty z groźnym wirusem – może on stać się uniwersalnym panaceum na wszystkie choroby albo położyć kres ludzkiej rasie. Kolejnym obiektem testów ma być dziewczynka Amy Bellafonte. Agent federalny Brad Wolgast otrzymuje rozkaz, żeby przywieźć ją do ośrodka, odmawia jednak wykonania zadania i postanawia zrobić wszystko, by ją chronić.