Takeru Tenkuuji, syn łowcy duchów, zostaje zamordowany przez złego Ganma, a następnie wskrzeszony przez tajemniczego pustelnika, który przekazuje mu Ghost Driver oraz Ghost Eyecon — urządzenie w kształcie kuli, pozwalające dostrzegać istoty z zaświatów, takie jak duchy zmarłych, Ganma i inni Riderzy. Pustelnik informuje Takeru, że ma 99 dni na zebranie 15 dodatkowych bohaterskich Eyeconów, które pozwolą mu powrócić do życia na stałe. Aby je zdobyć, musi walczyć z Ganma jako Kamen Rider Ghost.