22 lata po zaginięciu ojca Wataru Kurenai mieszka w osławionym „nawiedzonym domu”, gdzie jako Kamen Rider Kiva przeznaczone jest mu walczyć z Fangire'ami — gatunkiem wampirów wysysających siły życiowe, które mogą przybierać postać potworów przypominających witraże i z którymi jego ojciec walczył wiele lat wcześniej, zanim zaginął. Historia rozgrywa się naprzemiennie w dwóch okresach: współcześnie, gdy Wataru żyje w latach 2008–09, oraz w przeszłości, gdy jego ojciec Otoya żył w latach 1986–87, stopniowo ujawniając związek między rasą Fangire'ów a Kivą.