Gdzieś w Japonii znajduje się małe miasteczko otoczone przyrodą. W miasteczku tym mieści się duża i wspaniała szkoła Otobashi Gakuen, założona, by uczniowie mogli zbliżyć się do natury. Historia rozpoczyna się od Kurusugawa Himeko. Jest zwyczajną uczennicą uczęszczającą do Otobashi Gakuen. Wiedzie pełne radości i przyjemności szkolne życie wraz ze swoimi dwiema przyjaciółkami, Himekawa Chikane i Oogami Souma. Chikane jest jedyną córką szanowanej rodziny. Doskonale radzi sobie zarówno w nauce, jak i w sporcie. Jest także miła i piękna, przez co cieszy się dużą popularnością wśród innych uczniów. Oogami Souma jest przyjacielem Himeko z dzieciństwa. Ma problemy z bezpośrednim wyrażaniem emocji, ale jest bardzo szczery. W szesnaste urodziny Himeko ciemny księżyc przesłania słońce, a Orochi powstają, by zniszczyć świat. Ale dlaczego ich celem jest Himeko...?