Jodha Akbar to epicki dramat opowiadający szesnastowieczną historię politycznego małżeństwa z rozsądku między cesarzem Mogołów Abu'l-Fath Jalal ud-din Muhammad Akbar a radżpucką księżniczką Jodha Bai. Serial koncentruje się na tym, jak ich polityczne małżeństwo przeradza się w miłość, która zmienia losy Indii. Ten dramat historyczny przedstawia również ówczesne wojny oraz relacje między Mogołami a Radźputami. Fabuła skupia się także na funkcjonowaniu królowych, dworów, kurtyzan i ministrów oraz na ich wpływie na historię miłosną Jalal ud-din Muhammad Akbar i Jodha Bai. Serial ukazuje również, jak cesarz Mogołów Jalal ud-din Muhammad zyskuje wśród ludu tytuł Akbar.