Haruta Kamijou i Chika Homura znają się od wczesnego dzieciństwa i utrzymują bliską, przyjacielską relację. Teraz, kiedy oboje uczęszczają do liceum i zaczyna się czas pierwszych wielkich miłości, staje się to przyczyną powstawania krępujących sytuacji. Mimo to dwójka bohaterów uczestniczy w zajęciach klubu instrumentów dętych i wspólnie walczy o jego niepewną przyszłość. Pewnego dnia w szkole mają miejsce tajemnicze zdarzenia: za pomocą czerwonej cieczy ktoś maluje na szkolnej tablicy zapis nutowy nieokreślonej melodii. Haruta i Chika decydują się wspólnie rozwiązać powstałą zagadkę.