W roku L.C. 922 ludzie stanęli w obliczu nagłego kryzysu. W Tetra Heaven, krainie legend, zakończyła się trwająca sto lat wojna. Bogowie, którzy przegrali wojnę, szukali nowego miejsca do życia i znaleźli je w Septpia, świecie ludzi, który następnie zaatakowali. Logicalists należący do ALCA, specjalnej agencji policyjnej, której zadaniem była ochrona miast przed atakami przybyszów z zagranicy (aniołów), zostali zmuszeni do działania w obronie miast, niezależnie od tego, czy tego chcieli. W zależności od swoich umiejętności Logicalists mogli nawiązywać trance z boginiami z innego świata i zyskiwać szansę na walkę na polu bitwy. Cywil o imieniu Yoshichika Tsurugi, któremu brakowało „Logic” i który żył szczęśliwie ze swoją rodziną, został uwikłany w atak i schronił się wraz z wieloma innymi ludźmi. Spotyka piękną boginię o imieniu Athena. W jej rękach znajdowało się „Logic”, którego brakowało Yoshichice. Teraz Yoshichika i Athena zmierzają ku swojemu przeznaczeniu.