Yū Amagi to nieco ekscentryczny detektyw, który z Centrum Rzeczy Znalezionych został przydzielony do Dwunastej Sekcji Pierwszego Wydziału Śledczego Tokijskiej Policji Metropolitalnej. Dwunasta Sekcja nazywana jest „cmentarzyskiem detektywów” i wyśmiewana jako „pokój wygnania, do którego zsyła się zahartowanych detektywów, których nie można zwolnić”. Wchodzący w jej skład Kōsuke Samura, Takumi Yamashita, Keita Nagasawa, Tamaki Mizuta i Masatoshi Katagiri są elitą, a jednocześnie dziwakami. Amagi zdaje się mieć obsesję na punkcie czasu, który pozornie nie ma związku ze sprawą. Zadając pytania o chronologię działań sprawcy i ofiary, wynikającą z przewidywanego czasu śmierci, czasu popełnienia przestępstwa, czasu potwierdzającego alibi i terminu, poszukuje znaczenia „czasu pustki”, który się z tego wyłania. Z powodu pewnego zdarzenia obsesyjnie skupia się na wadze każdej minuty i sekundy.