Pewnego dnia miasto nagle zniknęło. Takuya, zawodowy kurier i samotny wilk, spotyka Yuki, jedyną ocalałą z tamtego miasta. Oboje polegają na wiadomościach pozostawionych przez ojca Yuki, który podobno zaginął. Dwójka bohaterów kieruje się do zaginionego miasta Lost. Jednakże spotykają wiele przeszkód na swojej drodze, które są szczególnie szokujące dla Yuki. Zmierzą się z uczuciami pozostawionymi za sobą, tajemniczą grupą manipulującą z cienia i tajemniczym spiskiem. Choć na początku główni bohaterowie byli sobie obcy, z dnia na dzień pogłębiają swoją więź podczas podróży i odkrywania sekretu miasta Lost.