Monachium, Niemcy, 1923 rok. Minęły dwa lata, odkąd Edward Elric został przeniesiony z własnego świata do naszego, pozostawiając za sobą swój kraj, przyjaciół i młodszego brata, Alphonse’a. Pozbawiony mocy alchemicznych, przez cały ten czas prowadził badania nad techniką rakietową razem z Alphonse Heiderichem, młodym mężczyzną przypominającym jego własnego brata, mając nadzieję, że pewnego dnia znajdzie sposób na powrót do domu. Jego dotychczasowe wysiłki nie przyniosły rezultatów, lecz po udzieleniu pomocy zaniepokojonej cygańskiej dziewczynie Edward zostaje wciągnięty w serię wydarzeń, które mogą sprowadzić chaos na oba światy. Tymczasem w swoim świecie Alphonse Elric zagłębia się w tajemnice alchemii w poszukiwaniu sposobu na ponowne połączenie z bratem.